因应2019冠状病毒病疫情，2020年1月31日，香港赛马会宣布在2月1日搅珠后，暂停六合彩搅珠直至另行通知。随着香港当地疫情趋缓，6月13日香港赛马会表示，将配合政府的最新政策审慎规划各项新安排，并打算由6月22日起，在非赛马日重开大部分场外投注处，提供户口与赛日前夕投注服务。香港赛马会又指有意重启六合彩搅珠。2020年7月3日，原本香港赛马会宣布将在7月21日恢复进行六合彩搅珠，然而香港当地再次爆发疫情，香港赛马会又暂时取消恢复扰珠[31]。
直到同年9月8日，香港赛马会宣布将于9月24日恢复六合彩搅珠，但只可经电话或网上投注，以避免人群在投注站聚集。而每星期只有一次搅珠，同样地该年亦不设中秋金多宝
